Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700018F24RikB2RW27 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
1700018F24RikB2RW27 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700018F24RikB2RW27 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700018F24RikB2RW27 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms