Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usf3B2RUQ2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usf3B2RUQ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usf3B2RUQ2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms