Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN2

Igsf23, Immunoglobulin superfamily, member 23, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf23B2RTN2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igsf23B2RTN2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Igsf23B2RTN2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Igsf23B2RTN2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Igsf23B2RTN2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms