Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Slc22a28B2RT89 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Slc22a28B2RT89 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc22a28B2RT89 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms