Protein–RNA interactions for Protein: B1B1D3

Zfp40, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp40B1B1D3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp40B1B1D3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp40B1B1D3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp40B1B1D3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp40B1B1D3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp40B1B1D3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp40B1B1D3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp40B1B1D3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp40B1B1D3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp40B1B1D3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp40B1B1D3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp40B1B1D3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp40B1B1D3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp40B1B1D3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp40B1B1D3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp40B1B1D3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp40B1B1D3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp40B1B1D3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms