Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf25B1AWN9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf25B1AWN9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf25B1AWN9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms