Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn1aA2APX8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scn1aA2APX8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn1aA2APX8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scn1aA2APX8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scn1aA2APX8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms