Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rhox3fA2ANE1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhox3fA2ANE1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhox3fA2ANE1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhox3fA2ANE1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms