Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lcn6A2AJB9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lcn6A2AJB9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lcn6A2AJB9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lcn6A2AJB9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lcn6A2AJB9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lcn6A2AJB9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lcn6A2AJB9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lcn6A2AJB9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lcn6A2AJB9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lcn6A2AJB9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lcn6A2AJB9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lcn6A2AJB9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lcn6A2AJB9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lcn6A2AJB9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lcn6A2AJB9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lcn6A2AJB9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lcn6A2AJB9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lcn6A2AJB9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lcn6A2AJB9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lcn6A2AJB9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms