Protein–RNA interactions for Protein: A2AHJ4

Brwd3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brwd3A2AHJ4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Brwd3A2AHJ4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Brwd3A2AHJ4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Brwd3A2AHJ4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Brwd3A2AHJ4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Brwd3A2AHJ4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Brwd3A2AHJ4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Brwd3A2AHJ4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Brwd3A2AHJ4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Brwd3A2AHJ4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Brwd3A2AHJ4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Brwd3A2AHJ4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Brwd3A2AHJ4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Brwd3A2AHJ4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Brwd3A2AHJ4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Brwd3A2AHJ4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Brwd3A2AHJ4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Brwd3A2AHJ4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Brwd3A2AHJ4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Brwd3A2AHJ4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Brwd3A2AHJ4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Brwd3A2AHJ4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Brwd3A2AHJ4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Brwd3A2AHJ4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Brwd3A2AHJ4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Brwd3A2AHJ4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Brwd3A2AHJ4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Brwd3A2AHJ4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Brwd3A2AHJ4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Brwd3A2AHJ4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Brwd3A2AHJ4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Brwd3A2AHJ4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Brwd3A2AHJ4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Brwd3A2AHJ4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Brwd3A2AHJ4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Brwd3A2AHJ4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Brwd3A2AHJ4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Brwd3A2AHJ4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Brwd3A2AHJ4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Brwd3A2AHJ4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Brwd3A2AHJ4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Brwd3A2AHJ4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Brwd3A2AHJ4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Brwd3A2AHJ4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Brwd3A2AHJ4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Brwd3A2AHJ4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Brwd3A2AHJ4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Brwd3A2AHJ4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Brwd3A2AHJ4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Brwd3A2AHJ4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Brwd3A2AHJ4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Brwd3A2AHJ4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Brwd3A2AHJ4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Brwd3A2AHJ4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Brwd3A2AHJ4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Brwd3A2AHJ4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Brwd3A2AHJ4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Brwd3A2AHJ4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms