Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyb561d1A2AE42 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cyb561d1A2AE42 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyb561d1A2AE42 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyb561d1A2AE42 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cyb561d1A2AE42 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyb561d1A2AE42 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyb561d1A2AE42 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyb561d1A2AE42 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyb561d1A2AE42 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyb561d1A2AE42 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyb561d1A2AE42 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cyb561d1A2AE42 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms