Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd5A2A8L1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd5A2A8L1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd5A2A8L1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd5A2A8L1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd5A2A8L1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd5A2A8L1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd5A2A8L1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd5A2A8L1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd5A2A8L1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd5A2A8L1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd5A2A8L1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Chd5A2A8L1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Chd5A2A8L1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chd5A2A8L1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd5A2A8L1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd5A2A8L1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd5A2A8L1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd5A2A8L1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd5A2A8L1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd5A2A8L1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd5A2A8L1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd5A2A8L1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd5A2A8L1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd5A2A8L1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd5A2A8L1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd5A2A8L1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd5A2A8L1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd5A2A8L1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd5A2A8L1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd5A2A8L1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd5A2A8L1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd5A2A8L1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd5A2A8L1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chd5A2A8L1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Chd5A2A8L1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd5A2A8L1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd5A2A8L1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd5A2A8L1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd5A2A8L1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd5A2A8L1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd5A2A8L1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd5A2A8L1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd5A2A8L1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd5A2A8L1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd5A2A8L1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chd5A2A8L1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chd5A2A8L1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chd5A2A8L1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chd5A2A8L1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chd5A2A8L1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chd5A2A8L1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Chd5A2A8L1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd5A2A8L1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Chd5A2A8L1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chd5A2A8L1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms