Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gm6268A2A3U9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm6268A2A3U9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm6268A2A3U9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm6268A2A3U9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm6268A2A3U9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm6268A2A3U9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm6268A2A3U9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm6268A2A3U9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm6268A2A3U9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm6268A2A3U9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm6268A2A3U9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm6268A2A3U9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm6268A2A3U9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm6268A2A3U9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm6268A2A3U9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gm6268A2A3U9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gm6268A2A3U9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gm6268A2A3U9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm6268A2A3U9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm6268A2A3U9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Gm6268A2A3U9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gm6268A2A3U9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm6268A2A3U9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms