Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Fam71e1A1L3C1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Fam71e1A1L3C1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fam71e1A1L3C1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fam71e1A1L3C1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fam71e1A1L3C1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fam71e1A1L3C1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fam71e1A1L3C1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fam71e1A1L3C1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Fam71e1A1L3C1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fam71e1A1L3C1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fam71e1A1L3C1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fam71e1A1L3C1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fam71e1A1L3C1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fam71e1A1L3C1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fam71e1A1L3C1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam71e1A1L3C1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam71e1A1L3C1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fam71e1A1L3C1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fam71e1A1L3C1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fam71e1A1L3C1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Fam71e1A1L3C1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fam71e1A1L3C1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 248.1 ms