Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm28919A0A087WP35 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm28919A0A087WP35 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm28919A0A087WP35 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28919A0A087WP35 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms