Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B657

Trdv1, T cell receptor delta variable 1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv1A0A075B657 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17,1■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17,09■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,09■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,09■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,33
Trdv1A0A075B657 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,08■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,08■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,07■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,07■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,07■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17,07■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,07■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,07■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17,06■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17,06■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17,05■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,04■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17,04■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17,04■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17,04■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17,04■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,03■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17,03■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17,03■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17,02■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17,02■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Trdv1A0A075B657 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,01■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,01■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17,01■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17,01■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,01■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,99■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16,99■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16,99■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16,99■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16,99■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Trdv1A0A075B657 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,97■□□□□ 0,31
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