Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm17190V9GX38 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm17190V9GX38 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm17190V9GX38 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm17190V9GX38 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm17190V9GX38 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm17190V9GX38 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm17190V9GX38 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm17190V9GX38 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm17190V9GX38 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17190V9GX38 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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