Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms