Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms