Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms