Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VarsQ9Z1Q9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VarsQ9Z1Q9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VarsQ9Z1Q9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VarsQ9Z1Q9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VarsQ9Z1Q9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VarsQ9Z1Q9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VarsQ9Z1Q9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VarsQ9Z1Q9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VarsQ9Z1Q9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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VarsQ9Z1Q9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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VarsQ9Z1Q9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VarsQ9Z1Q9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VarsQ9Z1Q9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VarsQ9Z1Q9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VarsQ9Z1Q9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VarsQ9Z1Q9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VarsQ9Z1Q9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VarsQ9Z1Q9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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VarsQ9Z1Q9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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VarsQ9Z1Q9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VarsQ9Z1Q9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms