Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

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Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ptpn4Q9WU22 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ptpn4Q9WU22 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ptpn4Q9WU22 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ptpn4Q9WU22 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms