Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf4Q9QZS2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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