Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms