Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nr4a3Q9QZB6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms