Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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