Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Exo1Q9QZ11 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms