Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snai3Q9QY31 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms