Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Opn4Q9QXZ9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Opn4Q9QXZ9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Opn4Q9QXZ9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Opn4Q9QXZ9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Opn4Q9QXZ9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Opn4Q9QXZ9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Opn4Q9QXZ9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Opn4Q9QXZ9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Opn4Q9QXZ9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn4Q9QXZ9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Opn4Q9QXZ9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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