Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChmQ9QXG2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms