Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TefQ9JLC6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TefQ9JLC6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TefQ9JLC6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TefQ9JLC6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TefQ9JLC6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TefQ9JLC6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TefQ9JLC6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TefQ9JLC6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TefQ9JLC6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TefQ9JLC6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TefQ9JLC6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TefQ9JLC6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TefQ9JLC6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TefQ9JLC6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TefQ9JLC6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TefQ9JLC6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TefQ9JLC6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms