Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cnot9Q9JKY0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms