Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx5Q9JKQ4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms