Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl39Q9JKF7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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