Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnga3Q9JJZ8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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