Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a4Q9JIS8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms