Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rpgrip1Q9EPQ2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms