Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clstn1Q9EPL2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms