Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne8Q9DC53 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms