Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms