Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Smg9Q9DB90 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Smg9Q9DB90 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Smg9Q9DB90 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Smg9Q9DB90 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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