Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Subh2bvQ9D9Z7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Subh2bvQ9D9Z7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Subh2bvQ9D9Z7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Subh2bvQ9D9Z7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Subh2bvQ9D9Z7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Subh2bvQ9D9Z7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Subh2bvQ9D9Z7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Subh2bvQ9D9Z7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Subh2bvQ9D9Z7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Subh2bvQ9D9Z7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Subh2bvQ9D9Z7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Subh2bvQ9D9Z7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Subh2bvQ9D9Z7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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