Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms