Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrameQ9D4Z5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms