Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gcc1Q9D4H2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcc1Q9D4H2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms