Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urm1Q9D2P4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urm1Q9D2P4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urm1Q9D2P4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urm1Q9D2P4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urm1Q9D2P4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urm1Q9D2P4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urm1Q9D2P4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Urm1Q9D2P4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Urm1Q9D2P4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms