Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc8Q9D2H8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fndc8Q9D2H8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms