Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms