Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms