Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssu72Q9CY97 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssu72Q9CY97 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms